A marca da Ecoporé é representada por uma pegada de uma onça-pintada, maior felino das Américas, não representa apenas a biodiversidade, mas é parte de nossa história, pois foi escolhida a partir de uma fotografia registrada por um dos fundadores da instituição no ano de 1989, durante uma operação de fiscalização na Reserva Biológica do Guaporé. Ao longo destes mais de 26 anos, passou por ajustes e algumas modificações, contudo sem perder sua essência, seu significado. A representação gráfica da instituição simboliza aquilo que já vivenciamos e acreditamos e é pautada dentro de nossos princípios, refletindo a cada momento aquilo que defendemos. Eis a nossa marca.